Sống trong một xã hội siêu nhân, thật khó để cảm thấy mình đặc biệt. Điều này càng đúng hơn khi ánh đèn sân khấu chỉ chiếu sáng các anh hùng chuyên nghiệp, những người được cấp phép hợp pháp để sử dụng năng lực đặc biệt của họ, gọi là Quirk, nơi công cộng vì lợi ích chung.
Kouichi Haimawari lớn lên với ước mơ trở thành anh hùng, nhưng với một Quirk tầm thường như "trượt" chỉ giúp anh bám sát mặt đất, anh nhanh chóng nhận ra rằng mình chỉ có thể ngưỡng mộ họ từ xa. Mặc dù vậy, Kouichi vẫn tìm thấy niềm vui trong việc sử dụng Quirk của mình để thực hiện những việc tốt hàng ngày, như trả lại đồ vật bị mất và giúp người già qua đường.
Tuy nhiên, cuộc sống bình lặng của Kouichi bất ngờ rẽ sang hướng hỗn loạn khi anh được cứu khỏi một cuộc ẩu đả trong con hẻm nhỏ bởi Knuckleduster, một Vigilante – hay còn gọi là "anh hùng bất hợp pháp." Nhận thấy tiềm năng làm anh hùng trong Kouichi, Knuckleduster chiêu mộ anh để giúp truy tìm nguồn gốc của một loại thuốc nguy hiểm có tên là Trigger, loại thuốc này làm tăng sức mạnh Quirk của người dùng nhưng khiến họ mất đi lý trí.
Lấy bối cảnh trước các sự kiện của câu chuyện gốc, Vigilante: Boku no Hero Academia Illegals theo chân Kouichi khi anh quyết định khoác lên mình danh xưng của một "phản diện" và trở thành Vigilante, hoạt động trong bóng tối của pháp luật để ngăn chặn tội phạm trỗi dậy trên bề mặt.